تاریخ درج۱۳۹۹/۰۴/۱۰
تعداد بازدید۱۵۳۷
موضوعات
امتیاز کاربران

دوره آموزشی غیرحضوری «شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD – پیشرفته»

دوره آموزشی غیرحضوری «شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD – پیشرفته» با تدریس مهندس واعظی از تاریخ 28 مردادماه در اختیار کاربران قرار می‌گیرد. این دوره شامل 4 ساعت ویدیوی آموزشی است. آزمون پایان دوره، 16 الی 2 مهرماه برگزار خواهد شد و شرکت‌کنندگانی که موفق به کسب نمره بالای 50 درصد شوند، گواهی پایان دوره را دریافت می‌کنند.

شبیه‌سازی دینامیک مولکولی در مقیاس نانو (NAMD) یک نرم‌افزار کامپیوتری برای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی است که با استفاده از مدل برنامه‌نویسی موازی ++Charm نوشته شده است؛ با توجه به بازده موازی و کارایی بالای این نرم‌افزار، اغلب از آن برای شبیه‌سازی سیستم‌های بزرگ (شامل میلیون‌ها اتم) و سیستم‌های بیومولکولی استفاده می‌شود. این نرم‌افزار در سال 1995 توسط نلسون و همکارانش به عنوان برنامه دینامیک مولکولی موازی ارائه شد که در کنار برنامه گرافیکی VMD قادر به شبیه‌سازی بود.

VMD برای مدلسازی، تجسم و تجزیه و تحلیل سیستم‌های زیستی نظیر پروتئین‌ها، نوکلئیک اسیدها و لایه‌های لیپیدی طراحی شده است؛ از آنجایی که این نرم‌افزار می‌تواند فایل‌های بانک داده پروتئین استاندارد (PDB) را بخواند و ساختار دربرگیرنده آن‌ها را نمایش دهد، می‌توان از آن برای مولکول‌های متداول‌تر نیز استفاده کرد. VMD از روش‌های مختلفی برای نمایش و رنگ‌آمیزی مولکول‌ها استفاده می‌کند و می‌تواند برای متحرک‌سازی و آنالیز شبیه‌سازی دینامیک مولکولی نیز استفاده شود. به صورت خاص این نرم‌افزار به عنوان نمای گرافیکی یک برنامه شبیه‌سازی دینامیک مولکولی استفاده می‌شود و قادر است تحرک مولکول را تحت شرایط شبیه‌سازی به صورت متحرک به نمایش درآورد.

 

 

دوره آموزشی غیرحضوری «شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD – پیشرفته» با تدریس آقای مهندس مهران واعظی از تاریخ  28 مردادماه در اختیار کاربران قرار می‌گیرد؛ این دوره شامل 4 ساعت ویدیو آموزشی است.

 

** آزمون پایان دوره 16 الی 2 مهرماه در سایت آموزش نانو به صورت آنلاین برگزار خواهد شد و شرکت‌کنندگانی که موفق به کسب نمره بالای 50 درصد شوند، گواهی پایان دوره را دریافت می‌کنند. افرادی که در تاریخ ذکر شده آزمون می‌دهند، گواهی خود را مهر 1399 دریافت خواهند‌ کرد.

 

***با توجه به اینکه این دوره شامل 4 ساعت ویدیو آموزشی است، هزینه ثبت‌نام در این دوره، 85 هزارتومان است.

 

نام دوره

مدرس

هزینه دوره گواهی پایان‌دوره ثبت‌نام
شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD – پیشرفته آقای مهندس مهران واعظی 85/000 تومان  دارد ثبت‌نام

 

 

زمان‌بندی دوره «شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نرم‌افزار NAMD و VMD – پیشرفته»
شروع‌ دسترسی پایان دسترسی آزمون ارسال گواهی
28 مردادماه تا پایان سال 16 الی 2 مهرماه مهرماه

 

 

این دوره در پلتفرم دستیار خوب (www.dastyarekhoob.ir) قابل مشاهده است.

 

برای دسترسی به دوره، ثبت‌نام‎کنندگان به پلتفرم دستیار خوب مراجعه کنند و برای ورود، اطلاعات خود را به صورت زیر وارد کنند:

ایمیل: ایمیل ثبت‌نامی

رمز عبور: کدملی 10 رقمی

گفتنی است از 28 مردادماه، اکانت دسترسی افراد ثبت‌نامی ایجاد شده و این دوره قابل مشاهده است.

 

آقای مهندس مهران واعظی

* دانشجوی دکتری فناوری نانو در پژوهشکده علوم و فناوری نانو دانشگاه صنعتی شریف

* دارای مدرک کارشناسی و کارشناسی ارشد فیزیک از دانشگاه صنعتی شریف

* سابقه تدریس نرم‌افزارهای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی (NAMD و LAMMPS) در دانشگاه شریف

* سابقه پژوهشی در زمینه شبیه‌سازی دینامیک مولکولی

 

1- آشنایی با کاربردهای شبیه‌سازی دینامیک مولکولی

2- آشنایی با مبانی شبیه‌سازی دینامیک مولکولی

3- آموزش نرم‌افزار VMD

4- آموزش طراحی کانال غشایی توسط نرم‌افزار VMD

5- آموزش پیاده‌سازی شبیه‌سازی با استفاده از نرم‌افزار NAMD

6- آموزش نحوه استخراج داده‌های خروجی و نحوه تحلیل داده‌ها

7- آموزش شبیه‌سازی SMD

8- بررسی عبور یون از کانال پروتئینی توسط شبیه‌سازی SMD

9- تحلیل داده‌های خروجی و محاسبه تغییرات انرژی آزاد

 

جهت ثبت‌نام 2 روش ممکن است:

1- جهت ثبت‌نام و پرداخت آنلاین می‌توانید از طریق دکمه زیر اقدام کنید:

 

2- ثبت‌نام از طریق صفحه شخصی کاربران:
به منظور ثبت‌نام باید پس از ورود به سایت از طریق لینک زیر، مراحل بعدی را انجام دهید:

http://profile.nano.ir

ثبت‌نام در این دوره‌ از طریق صفحه شخصی اعضا در سایت ستاد قسمت کارتابل افراد (حمایت تشویقی) صورت می‌گیرد.


 

برای کسب اطلاعات بیشتر درباره دوره با شماره‌  09104712036 تماس حاصل فرمایید.